こちらの競馬用語wikiによると

馬番号二連勝単式勝馬投票法のこと。
１着と２着になる馬の馬番号を着順通りに的中させる投票法。

平成14年に再び導入された。

とある。

重要な点は以下の２つ。

１．２頭の馬を予想する

２．１着と２着の着順まで的中させる

馬連に比べると単純に的中させるのが二倍難しくなっているが
オッズがそのまま２倍になっているとは限らないことに留意もしたい。
逆に２倍以上になる場合もあります。

ありえる状況としては

①出走する馬のうち２頭とも人気が高い場合

②出走する馬のうち１頭のみが人気が高い場合

まず①の場合には馬単も馬連もオッズに大差がないことが多い。
注意したいのは②の場合で、１頭のみが確実に入着してくるだろうと考えた場合、
人気薄の馬が１頭・人気が高かった馬が２着になった時馬単の配当がものすごいことになるのである。

上の説明ではちょっと理解しにくいかもしれませんが、初心者は特に把握しておきたいところ。

結論としては状況に応じて馬単と馬連を使い分ける！
これに尽きると思います。