三大始祖(さんだいしそ)とは、現代のサラブレッドの直系父系を遡った根幹種牡馬と言われるEclipse、Herod、Matchem3頭の種牡馬のこと。 三大根幹種牡馬とも呼ばれている。
根幹種牡馬の馬名はバイアリーターク、ゴドルフィンアラビアン、ダーレーアラビアンであり、 現在ではサラブレッドの90%近くがダーレーアラビアン系であるとされている。